Dubokim učenjem došli do informacija o bioaktivnosti milijuna molekula

Alat Laboratorija za strukturnu bioinformatiku i mrežnu biologiju pri IRB Barcelona predviđa biološku aktivnost kemijskih spojeva i ključne informacije za procjenu njihovog terapijskog potencijala

Mladen Smrekar četvrtak, 1. srpnja 2021. u 06:00

Koristeći umjetne neuronske mreže, znanstvenici su izveli eksperimentalne podatke za milijun spojeva i razvili paket programa za procjenu bilo koje vrste molekula. Njihov rad objavljen je u časopisu Nature Communications.

Laboratorij za strukturnu bioinformatiku i mrežnu biologiju pod vodstvom dr. Patricka Aloya dovršio je podatke o bioaktivnosti za milijun molekula. Tim je osmislio i alat za predviđanje biološke aktivnosti bilo koje molekule, čak i kada nisu dostupni eksperimentalni podaci.

Detalj iz zbirke uzoraka
Detalj iz zbirke uzoraka

Najveća baza podataka

Ova nova metodologija temelji se na Chemical Checkeru, najvećoj bazi podataka profila bioaktivnosti za pseudo lijekove, koju je isti laboratorij razvio i objavio 2020. Chemical Checker prikuplja podatke iz 25 prostora bioaktivnosti za svaku molekulu. Ti su prostori povezani s kemijskom strukturom molekule, ciljevima s kojima ona djeluje ili promjenama koje izaziva na kliničkoj ili staničnoj razini. 

Znanstvenici su izveli eksperimentalne podatke za milijun spojeva
Znanstvenici su izveli eksperimentalne podatke za milijun spojeva

Međutim, ove vrlo detaljne informacije o mehanizmu djelovanja nepotpune su za većinu molekula, što implicira da za određenu mogu postojati podaci za jedan ili dva prostora bioaktivnosti, ali ne i za svih 25. Istraživači su sad sve dostupne informacije povezali  metodama dubokog strojnog učenja.

Predviđanja i pouzdanost

Podaci o bioaktivnosti predviđeni modelom imaju veći ili manji stupanj pouzdanosti, ovisno o raznim faktorima, uključujući količinu dostupnih eksperimentalnih podataka i značajke molekule. 

Novi alat omogućuje predviđanje prostora bioaktivnosti novih molekula
Novi alat omogućuje predviđanje prostora bioaktivnosti novih molekula

"Svi su modeli pogrešni, ali neki su korisni! Mjera pouzdanosti omogućuje nam da bolje interpretiramo rezultate i istaknemo koji su prostori bioaktivnosti molekule točni", objašnjava prvi autor dr. Martino Bertoni. 

Besplatna softverska knjižnica

"Novi alat omogućuje predviđanje prostora bioaktivnosti novih molekula; to je presudno u procesu otkrivanja lijekova jer možemo odabrati najprikladnije kandidate i odbaciti loše", objašnjava Dr. Aloy.

Ova softverska knjižnica je slobodno dostupna znanstvenoj zajednici, a istraživači će je redovito ažurirati kako bude postajalo dostupno više podataka o biološkoj aktivnosti. Sa svakim ažuriranjem eksperimentalnih podataka u Chemical Checkeru, umjetne neuronske mreže također će se revidirati kako bi se poboljšale procjene.



Posjetite našu Hi-Fi slušaonicu.

Ronis Velesajam

Rezervirajte termin u našoj Hi-Fi slušaoni Ronis Velesajam i iskusite zvuk najpoznatijih svjetskih Hi-Fi brendova.

Kupi

Za ljubitelje tradicionalnog britanskog zvuka.

Akcija

FALCON ACOUSTICS M10

2-smjerni bas-refleks monitor, 5” Falcon B110 niskotonac, 25 mm SEAS soft dome visokotonac, 40 Hz – 25 kHz frekvencijski odziv, 8 Ω impedancija, 86 dB osjetljivost, 100 W maksimalna snaga, 4 mm nikal-platirani terminali, prirodni furnir Walnut, 7,5 kg po komadu.

2.174,00 € 2.899,00 € Kupi

Širokopojasna čistoća bez izobličenja.

Akcija

ACOUSTIC ENERGY AE1 ACTIVE

Aktivni zvučnici snage 2 x 50 W s integriranim A/B pojačalom i aktivnim mrežama za filtriranje, frekvencijskog raspona 40Hz-25kHz +/-6dB, čista keramičko aluminijska konus tehnologija, 27mm visokotonac s aluminijskom kupolom, jedinstveni WDT valovod za poboljšanu pokrivenost prostorija,

1.192,00 € 1.490,00 € Akcija

Dizajnirani da oduševe.

Preporuka

ARGON AUDIO Fenris A4

Aktivan zvučnik, 2 x 50 Watta (Wooferi), 2 x 25 Watta (Tweeter) - Bluetooth 5.0, optički digitalni ulaz (24bit/48kHz), HDMI ARC - MM ulaz za gramofon, izlaz za subwoofer

249 € Kupi

Beam Optical kabel

Akcija

BLACK RHODIUM Beam optical toslink 1,5 m

Optički kabel, Toslink konektori s pozlaćenim unutarnjim pinovima, Visokokvalitetni 6 mm plastični vlaknasti kabel za nizak gubitak, Razne primjene uključujući HDTV, DVD, Blu-Ray, Set Top Box uređaje, DAC-ove, kao i neke PC-e i prijenosnike.

47 € 52,96 € Akcija

Oživite glazbu i filmove uz High Fidelity zvuk.

Preporuka

JBL MA510 AV receiver

JBL MA510 5.2 AV receiver s podrškom za 8K HDMI, Dolby Vision i HDR10+, 75 W po kanalu (8 Ω), Wi-Fi i Bluetooth povezivost, podrška za FLAC, ALAC i WAV, Pure Direct način rada, 192kHz/24-bit DAC, dual sub izlazi.

789 € Kupi

Pogodan za srednje i velike sobe.

Akcija

ACOUSTIC ENERGY AE309 zvučnici

2.5-sistemski zvucnici sa 130mm mid-bass jedinicama i 28mm aluminijskim visokotoncem, frekvencijski raspon 38Hz -30kHz, osjetljivost 89dB, vršni SBL 115dB, snaga 175W, crossover frekvencija 296Hz / 2.56kHz, impedancija 6 ohma.

1.189 € 1.399 € Akcija

Integrirano pojačalo klasičnog stila.

JBL SA550 Classic

Integrirano pojačalo s 2x90W na 8Ω, 2x150W na 4Ω, THD 0.002%. Phono MM ulaz: 5mV osjetljivost, 47kΩ impedancija, S/N 80dB. Linijski ulazi: 1V osjetljivost, 106dB S/N. Digitalni ulazi (optički/koaksijalni): 16–24 bit, do 192kHz, S/N 115dB. Dimenzije: 449x114x327 mm, masa 12 kg.

1.989 € Akcija

Dobitnici nagrade What Hi-Fi? 2024

WHARFEDALE Diamond 12.3

2.5-stazni podni bas-refleks zvučnici, 2 x 130 mm PP bas driver, 25 mm tekstilni visokotonac, preporučena snaga pojačala 30–150 W, nominalna impedancija 8 Ω, minimalna 4,6 Ω, osjetljivost 87,5 dB, frekvencijski raspon 45 Hz – 20 kHz

849,00 € Kupi

Izuzetno sofisticirani sklopovi.

YAMAHA CD-S303 CD player

HybridDigital UcD pojačalo, 2 x 80 W (8/4 Ω), bridged do 300 W, ESS SABRE™ DAC (32-bit/384kHz), 2 MDC 2 utora, MM Phono pretpojačalo, pojačalo za slušalice, HDMI eARC, optički i koaksijalni ulazi, 2 izlaza za subwoofer.

379 € Kupi

Zapanjujuća kvaliteta zvuka.

CAMBRIDGE AUDIO CXN 100 streamer

ESS ES9028Q2M SABRE32 Reference DAC, StreamMagic Gen4 moduli, MQA, Spotify Connect, TIDAL Connect, Qobuz, Deezer za najbolji zvuk, Internet Radio s MPEG-DASH podrškom, Roon Ready, USB audio, Coaxial,TOSLINK, Chromecast, AirPlay 2 i Bluetooth

1.089 € Kupi